出村 誠教授 (DEMURA Makoto)
- 研究室
- 生物情報解析科学研究室
- 研究テーマ
- 生命の機能・情報分子の担い手であるタンパク質、細胞膜などの構造機能相関の解明、SDGs
- 研究キーワード
ぺプチド、タンパク質、膜タンパク質構造、機能解析、フォールディング、NMR、光生物学、ロドプシン、細胞死、バイオインフォマティクス、SDGs
研究内容
ロドプシンタンパク質は古細菌からヒトまで存在し、視覚センサー、光情報伝達系として興味深い生命活動を担っています。 分子構造や光受容サイクルはおどろくほど類似しているものの、タンパク質ごとに個別機能を示します。 私たちの研究室では、古細菌型ロドプシンを遺伝子工学的に探索し、イオン選択輸送や光情報伝達メカニズムを研究しています。
タンパク質の構造決定・予測とバイオインフォマティクス
ゲノム情報が多数解読され、またタンパク質の立体構造もX線結晶解析やNMR構造解析で網羅的に解析されています。 実験的に得られた三次構造データベースから未知タンパク質の構造予測と構造精密化法の開発が期待できます。 ゲノム情報とNMRデータ解析など計算科学と実験科学の融合から生命情報解析科学の新領域の発展を目指します。
生命科学の産業応用と展開・持続可能な開発目標(SDGs)
担当学部・大学院
- 理学部担当:
生物科学科(高分子機能学),基幹講座 - 大学院生命科学院担当:
ソフトマター専攻,ソフトマター生命分子科学
代表的な研究業績
Takashi Tsukamoto, Chihiro Kikuchi, Hiromu Suzuki, Tomoyasu Aizawa,Takashi Kikukawa & Makoto Demura, Implications for the impairment of the rapid channel closing of Proteomonas sulcata anion channelrhodopsin 1 at high Cl− concentration, Scientific Reports, 8:13445 (2018)
Gang Dai, Xiong Geng, Chaoluomeng, J. Tamogami, T. Kikukawa, M. Demura, N. Kamo, T. Iwasa, Photocycle of Sensory Rhodopsin II from Halobacterium salinarum (HsSRII): Mutation of D103 Accelerates M Decay and Changes the Decay Pathway of a 13‐cis O‐like Species, Photochemistry and Photobiology, 94, 705–714 (2018)
Tamogami, T. Kikukawa, K. Ohkawa, N. Ohsawa, T. Nara, M. Demura, S. Miyauchi, T. Kimura-Someya, M. Shirouzu, S. Yokoyama, K. Shimono, N. Kamo, Interhelical interactions between D92 and C218 in the cytoplasmic domain regulate proton uptake upon N-decay in the proton transport of Acetabularia rhodopsin II, Journal of Photochemistry & Photobiology, B: Biology183, 35-45 (2018)
Nakajima, T. Tsukamoto, Y. Kumagai, Y. Ogura, T. Hayashi, J. Song, T. Kikukawa, M. Demura, K. Kogure, Y. Sudo, S. Yoshizawa, Presence of a Haloarchaeal Halorhodopsin-Like Cl- Pump in Marine Bacteria, Microbes Environ. , 2018 Mar 16.
Md. Ruhul Kuddus, Megumi Yamano, Farhana Rumi, Takashi Kikukawa, Makoto Demura, Tomoyasu Aizawa, Enhanced expression of cysteine-rich antimicrobial peptide snakin-1 in Escherichia coli using an aggregation-prone protein coexpression system, Biotechnology progress, 2017 May 27.
北大研究者総覧参照
(https://researchers.general.hokudai.ac.jp/profile/ja.1QHsBood918oE.TupnhdqQ==.html)
備考
<オフィスアワー>
・訪問受け入れ日時:講義期間中はいつでも
・居室:理学部2号館8階2-805室
※不在の場合があるため下記メールアドレスへ事前連絡の上来室してください。
demura[at]sci.hokudai.ac.jp
所属
- 大学院先端生命科学研究院,生命機能科学研究部門,生物情報解析科学研究分野
- 次世代物質生命科学研究センター,国際連携ユニット,ソフトマター国際連携ユニット(GI-CoRE協力拠点)