2012 : Biomics Hub

Publications

  1. Nozawa R.S., Nagao K., Igami K.T., Shibata S., Shirai N., Nozaki N., Sado T., Kimura H., and Obuse C.
    Human inactive X chromosome is compacted through a polycomb-independent SMCHD1-HBiX1 pathway governed by XIST RNA.
    Nature Struct. Mol. Biol., in press.
  2. Osakabe A., Tachiwana H., Takaku M., Hori T., Obuse C,. Kimura H., Fukagawa T., and Kurumizaka H.
    Vertebrate Spt2 is a novel nucleolar histone chaperone that assists in ribosomal DNA transcription.
    J. Cell Sci., in press.
  3. Arai R., Tsuda M., Watanabe T., Ose T., Obuse C., Maenaka K., Minami A., and Ohba Y.
    Simultaneous inhibition of Src and Aurora kinases by SU6656 induces therapeutic synergy in human synovialsarcoma growth, invasion and angiogenesis in vivo.
    Eur. J. Cancer, 48, 2417-30 (2012)
  4. Nakaoka Y., Miki T., Fujioka R., Uehara R., Tomioka A., Obuse C., Kubo M., Hiwatashi Y., and Goshima G.
    An Inducible RNA Interference System in Physcomitrella patens Reveals a Dominant Role of Augmin in Phragmoplast Microtubule Generation.
    Plant Cell, 24, 1478-93 (2012)
  5. Moriyama K., Yoshizawa-Sugata N., Obuse C., Tsurimoto T., and Masai H.
    Epstein-Barr Nuclear Antigen 1 (EBNA1)-dependent Recruitment of Origin Recognition Complex (Orc) on oriP of Epstein-Barr Virus with Purified Proteins: STIMULATION BY Cdc6 THROUGH ITS DIRECT INTERACTION WITH EBNA1.
    J. Biol. Chem.,287, 23977-94 (2012)
  6. Sato K., Ishiai M., Toda K., Furukoshi S., Osakabe A., Tachiwana H., Takizawa Y., Kagawa W., Kitao H., Dohmae N., Obuse C., Kimura H., Takata M., and Kurumizaka H.
    Histone chaperone activity of Fanconi anemia proteins, FANCD2 and FANCI, is required for DNA crosslink repair.
    EMBO J., 31, 3524-36 (2012)
  7. Maehara K., Odawara J., Yoshimi T., Koji Nagao., Obuse C., Akashi K., Tachibana T., Sakata T., and Ohkawa Y.
    A co-localization model of paired ChlP-seq data using a large ENCODE data set enables comparison of multiple samples.
    Nucl. Acids Res.,41, 54-62 (2012)
  8. Tsukuda Y., Iwasaki N., Seito N., Kanayama M., Fujitani N., Shinohara Y., Kasahara Y. Onodera T., Suzuki K., Asano T., Minami A., Yamashita T.
    Ganglioside GM3 has an essential role in the pathogenesis and progression of rheumatoid arthritis
    PLOS One 7, e40136 (2012)
  9. Otani M., Kuroki A., Kikuchi S., Kihara M., Nakata J., Ito K., Furukawa J., Shinohara Y. and Izui S.
    Sialylation Determines the Nephritogenicity of IgG3 Cryoglobulins
    J. Am. Soc. Nephtol. 23, 1869-1878 (2012)
  10. Fujitani N., Furukawa J., Araki K., Fujioka T., Takegawa Y., Piao J., Nishioka T., Tamura T., Nikaido T., Ito M., Nakamura, Y., Shinohara Y.
    Total cellular glycomics allows characterizing cells and streamlining the discovery process for cellular biomarkers
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 110, 2105-2110 (2013)

Books etc

  1. 野澤竜介・小布施力史
    ヘテロクロマチンタンパク質によるAuroraBキナーゼ複合体の局在と活性化のメカニズム
    生化学 84(2), 129-133（2012）
  2. Furukawa, J., Fujitani, N., Shinohara, Y.
    Recent advances in cellular glycomic analyses
    Biomolecules 3, 198-225 (2013)
  3. Katayama, T., Wilkinson, M. D., Micklem, G., Kawashima, S., Yamaguchi, A., Nakao, M., Yamamoto, Y., Okamoto, S., Oouchida, K., Chun, H. W., Aerts, J., Afzal, H., Antezana, E., Arakawa, K., Aranda, B., Belleau, F., Bolleman, J., Bonnal, R. J., Chapman, B., Cock, P., Eriksson, T., Gordon, P., Goto, N., Hayashi, K., Horn, H., Ishiwata, R., Kaminuma, E., Kasprzyk, A., Kawaji, H., Kido, N., Kim, Y. J., Kinjo, A. R., Konishi, F., Kwon, K. H., Labarga, A., Lamprecht, A. L., Lin, Y., Lindenbaum, P., McCarthy, L., Morita, H., Murakami, K., Nagao, K., Nishida, K., Nishimura, K., Nishizawa, T., Ogishima, S., Ono, K., Oshita, K., Park, K., Prins, P., Saito, T. L., Samwald, M., Satagopam, V. P., Shigemoto, Y., Smith, R., Splendiani, A., Sugawara, H., Taylor, J., Vos, R., Withers, D., Yamasaki, C., Zmasek, C. M., Kawamoto, S., Okubo, K., Asai, K., and Takagi, T.
    The 3rd DBCLS BioHackathon: improving life science data integration with semantic Web technologies.
    J. Biomed .Semantics, 4, pp 6 (2013)

Conference Activities & Talks

(Invited talk)

  1. April 2012
    Lucca (Barga), Italy
    Gordon research conference, Glycolipid & Sphingolipid Biology
    Qualitative cellular glycomics of glycosphingolipids and other classes of complex carbohydrates as cellular descriptors
    Shinohara Y.

Invited talk (in Japan)

  1. 2012年1月
    名古屋市
    愛知県がんセンター研究所　　
    不活性X染色体における構成的ヘテロクロマチンと条件的ヘテロクロマチンのクロストーク
    小布施力史
  2. 2012年5月
    木更津市
    公益財団法人かずさDNA研究所
    不活性X染色体における構成的ヘテロクロマチンと条件的ヘテロクロマチンのクロストーク
    小布施力史
  3. 2012年5月
    東京都
    第6回日本エピジェネティクス研究会年会
    不活性X染色体における構成的ヘテロクロマチンと条件的ヘテロクロマチンとのクロストーク
    小布施力史
  4. 2012年7月
    東京都
    日本プロテオーム学会2012年大会
    タンパク質複合体の構成因子を同定するための試料調整法
    小布施力史
  5. 2012年7月
    仙台市
    第14回日本RNA学会年会
    不活性Ｘ染色体における非コードRNA XISTを介したヘテロクロマチン形成機構
    小布施力史
  6. 2012年8月
    豊中市
    大阪大学大学院　分子遺伝学研究室
    ヒトHP1結合タンパク質から見えてきたヘテロクロマチンの構造と機能—不活性X染色体における非コードRNA XISTを介したヘテロクロマチン形成機構—
    小布施力史
  7. 2013年3月
    和光市
    独立行政法人理化学研究所
    HP1によるクロマチンの機能構造の理解
    小布施力史
  8. 2013年3月
    京都市
    京都大学　第133回 アイセムスセミナー
    Total cellular glycomics: a glycomic approach to describe cells and streamline the discovery process for cellular biomarkers
    篠原康郎
  9. 2012年10月
    札幌市
    第10回未来創薬・医療イノベーション拠点形成国際シンポジウム
    総合グライコミクス：細胞マーカー探索の新技術
    篠原康郎
  10. 2012年9月16日
    京都市
    Mascotワークショップ2012
    網羅的にタンパク質間相互作用を同定するための半定量プロテオミクス解析
    長尾恒治

Patent

  1. 特願2012-132201
    PCT/JP2012/078651