2009 : Biomics Hub

Publications

  1. Uehara R., Nozawa R., Tomioka A., Petry S., Vale R.D., Obuse C., Goshima G.
    The augmin complex plays a critical role in spindle microtubule generation for mitotic progression and cytokinesis in human cells.
    Proc.Natl.Acad.Sci. USA., 106, 6998-7003 (2009).
  2. Hanyu Y., Imai K, K., Kawasaki,Y., Nakamura T., Nakaseko Y., Nagao K., Kokubu A., Ebe M., Fujisawa A., Hayashi T., Obuse C., Yanagida M.
    S. pombe cell division cycle under limited glucose requires Ssp1 kinase, the putative CaMKK, and Sds23, a PP2A-related phosphatase inhibitor.
    Genes to Cells, 14, 539-54 (2009).
  3. Perpelescu M., Nozaki N., Obuse C., Yang H., Yoda Y.
    Active establishment of centromeric CENP-A chromatin by RSF complex
    J.Cell Biol., 185, 397-407 (2009).
  4. Suizu F., Hiramuki Y., Okumura F., Matsuda M., Okumura J. A., Hirata N., Narita M., Kohno T., Yokota J., Bohgaki M., Obuse C., Hatakeyama S., Obata T., Noguchi M.
    The E3 ligase TTC3 facilitates ubiquintination and degradation of phosphorylated Akt
    Dev.Cell., 17, 800-10 (2009).
  5. KiyomitsuT., Iwasaki O., Obuse C., Yanagida M.
    Inner centromere formation requires hMis14, a trident kinetochore protein that specifically recruits HP1 to human chromosomes
    J Biol Chem., 285, 9858-67 (2009).
  6. Osakabe, A., Tachiwana, H., Matsunaga, T., Shiga, T., Nozawa, R., Obuse, C., Kurumizaka, H.
    Nucleosome Formation Activity of Human Somatic Nuclear Autoantigenic Sperm Protein (sNASP)
    J Biol Chem., 285, 11913-21.
  7. Suehara Y., Kikuta K., Nakayama R., Fujii K., Ichikawa H., Shibata T., Seki K., Hasegawa T., Gotoh M., Tochigi N., Shimoda T., Shimada Y., Sano T., Beppu Y., Kurosawa H., Hirohashi S., Kawai A., Kondo T.
    Anatomic site-specific proteomic signatures of gastrointestinal stromal tumors.
    Proteomics Clin. Appl., 3, 584-96 (2009).
  8. Suehara Y., Kikuta K., Nakayama R., Tochigi N., Seki K., Ichikawa H., Fujii K., Hasegawa T., Shimoda T., Kurosawa H., Chuman H., Beppu Y., Kawai A., Hirohashi S., Kondo T.
    GST-P1 as a histological biomarker of synovial sarcoma revealed by proteomics.
    Proteomics Clin. Appl., 3, 623-34 (2009).
  9. Kawase H., Fujii K., Miyamoto M., Kubota K. C., Hirano S., Kondo S., Inagaki F.
    Differential LC-MS-based proteomics of surgical human cholangiocarcinoma tissues.
    J Proteome Res., 8, 4092-103 (2009).
  10. Kawamura T., Nomura M., Tojo H., Fujii K., Hamasaki H., Mikami S., Bando Y., Kato H., Nishimura T.
    Proteomic analysis of laser-microdissected paraffin-embedded tissues: (1) Stage-related protein candidates upon non-metastatic lung adenocarcinoma.
    J Proteomics., 73, 1089-99（ 2010）
  11. Nishimura T., Nomura M., Tojo H., Hamasaki H., Fukuda T., Fujii K., Mikami S., Bando Y., Kato H.
    Proteomic analysis of laser-microdissected paraffin-embedded tissues: (2) MRM assay for stage-related proteins upon non-metastatic lung adenocarcinoma.
    J Proteomics., 73, 1100-10（ 2010）
  12. Fujii K., Nakamura S., Takahashi K., Inagaki F.
    Systematic characterization by mass spectrometric analysis of phosphorylation sites in IRF-3 regulatory domain activated by IKK-i.
    J Proteomics., 73, 1196-203（ 2010）
  13. Matsushita T., Sadamoto R., Ohyabu N., Nakata H., Fumoto M., Fujitani N., Takegawa Y., Sakamoto T., Kurogochi M, Hinou H., Shimizu H., Ito T., Naruchi K., Togame H., Takemoto H., Kondo H., Nishimura S.-I.
    “Functional neoglycopeptides: synthesis and characterization of a new class of MUC1 glycoprotein models having core 2-based O-glycan and complex-type N-glycan chains.”
    Biochemistry., 48, 11117-33（ 2009）
  14. Tano C., Son S.-H. , Furukawa J.-i., Furuike T., Sakairi N..
    Enantiomeric separation by MEKC using dodecyl thioglycoside surfactants: importance of an equatorially oriented hydroxy group at C-2 position in separation of dansylated amino acids
    Electrophoresis., 30 (15), 2743-6 (2009).
  15. SonS.-H. , Yanagiya N., Furukawa J.-i., Sakairi N.,
    Intramolecular Glycosylation Approach toward Constructing the Macrocyclic Structure of Resin Glycosides
    Synlett, 2957-60 (2009).
  16. Amano M., Yamaguchi M., Takegawa Y., Yamashita T., Terasima M., Furukawa J.-i., Miura Y., Shinohara Y., Iwasaki N., Minami A., Nishimura S.-I.
    Threshold in Stage Specific Embryonic Glycotypes Uncovered by a Full Portrait of Dynamic N-Glycan Expression during Cell Differentiation.
    Mol. Cell. Proteomics., 9, 523-37 (2010) .
  17. Kimura A., Tandang M.-R., Fukuda T., Cabanos C., Takegawa Y., Amano M., Nishimura S.-I., Matsumura Y., Maruyama N., Utsumi S.
    Carbohydrate moieties contribute significantly to the excellent physicochemical properties of French bean 7S globulin phaseolin.
    J. Agric. Food. Chem., 58, 2923-30 (2010).
  18. Takeda, K., Yoshida, Y., Kikuchi, S., Nagao, K., Kokubu, A., Pluskal, T., Villar-Briones, A., Nakamura, T., Yanagida, M.
    Synergistic Roles of Proteasome and Autophagy for Mitochondrial Maintenance and Chronological Life Span.
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 107, 3540-5 (2010).
  19. Kimura A., Tandang-Silvas M.R.G., Fukuda T.,Cabanos C.,† Takegawa Y., Amano M., Nishimura S.-I., Matsumura Y., Utsumi S., and Maruyama N.
    Carbohydrate Moieties Contribute Significantly to the Physicochemical Properties of French Bean 7S Globulin Phaseolin
    J. Agric. Food Chem., 58, 2923-30 (2010).

Books etc

  1. 清光智美、小布施力史、柳田充弘
    ブリンキン－紡錘体形成チェックポイントと微小管結合に必須なキネトコア蛋白質．染色体サイクル（正井久雄・升方久夫・釣本敏樹・仁木宏典・篠原 彰　編）
    蛋白質・核酸・酵素（増刊）, 54, 421-6（ 2009）.
  2. 野澤竜介、小布施力史
    ヘテロクロマチン結合因子とその機能 細胞核－遺伝情報制御と疾患
    実験医学（増刊）, 27,123-30（ 2009）.
  3. 長尾恒治、野澤竜介、小布施力史
    染色体を構築する複合体のプロテオミクス解析．明日を拓く新次元プロテオミクス
    細胞工学（別冊）, 81-90（ 2009）.
  4. 藤井清永、中野智世、碓井史彦、板東泰彦、稲垣冬彦、西村俊秀
    プロテオーム解析におけるLC/MS3法の有用性について
    質量分析, 57, 317-325（ 2009）.
  5. 天野麻穂
    本当は、どこを見ているの？～癌特異的糖ペプチド抗原の探索～
    臨床化学, 39, 81（ 2010）.

Conference Activities & Talks

(Invited talk)

  1. November 2009
    Sapporo, Japan
    International mini-symposium on chromosome biology : Centromeres to telomeres and te chromatin between
    An HP1 binding protein POGZ has pivotal role in mitotic chromosome organization in human cells
    Obuse Chikashi.
  2. October 2009
    Sapporo, Japan
    The 1st Hokkaido University-Academia Sinica Joint Symposium
    Unambiguous identification of multiple O-glycosylation sites using electron capture dissociation with various electron energies
    Takegawa Y.
  3. July 2009
    Vienna, Austria
    15th European Carbohydrate Symposium
    Comparative Glycomics
    Maho Amano.
  4. October 2009
    Sapporo, Japan
    The 1st Hokkaido University-Academia Sinica Joint Symposium and The 7th Symposium For Future Drug Discovery and Medical Care
    Comparative Glycomics
    Maho Amano.
  5. December 2009
    San Juan, Puerto Rico, USA
    20th International Symposium on Glycoconjugates
    Quantitative Glycomics During Cellular Differentiation
    Maho Amano.

Invited talk (in Japan)

  1. 2009年10月
    神戸市
    第82回日本生化学会大会
    pogoトランスポゾン由来のジンクフィンガー蛋白質POGZはHP1との結合を介して染色体分配に関与する
    小布施力史
  2. 2009年11月
    三島市
    ヘテロクロマチン結合タンパク質とその機能
    平成21年度遺伝研研究会
    小布施力史
  3. 2009年7月
    仙台市
    第2回東北大学医学部系グローバルCOE拠点シンポジウム
    「最先端プロテオーム解析技術を用いた疾患バイオマーカー探索の実際」
    藤井清永
  4. 2009年7月
    東京都
    日本ヒトプロテオーム機構（JHUPO）第7回大会
    「セミ定量スペクトルカウント法を用いたLC-MSによるバイオマーカー探索」
    藤井清永
  5. 2010年2月
    横浜市
    サーモフィッシャーサイエンティフィック“Orbitrapユーザーズフォーラム2010”
    「LTQ-Orbitrapを用いた翻訳後修飾解析とバイオマーカー探索の実際について」
    藤井清永
  6. 2009年9月
    横浜市
    ブルカー・ダルトニクス　ユーザーミーティング2009
    超微量血清からの網羅的糖鎖解析と疾患診断への応用
    古川潤一

Patent

  1. 2010/3/4 （特願2010-048003）
    アルツハイマー病の検査方法、アルツハイマー病に対して治療効果を有する物質のスクリーニング方法およびアルツハイマー病の検査キット
    発明者：稲垣冬彦、藤井清永、東海林幹夫、渡辺光法、佐々木秀直、矢部一郎、上田哲也
  2. 2010/3/4 （特願2010-048004）
    多発性硬化症の検査方法、多発性硬化症に対して治療効果を有する物質のスクリーニング方法および多発性硬化症の検査キット
    発明者：稲垣冬彦、藤井清永、佐々木秀直、矢部一郎、東海林幹夫、渡辺光法、上田哲也
  3. 2009, 7598372 (US)
    Synthesis of core sugar chain structures of asparagines-linked glycoprotein
    発明者：Nishimura, S.-I., Takegawa, Y.
  4. （特願2009-220893）
    「糖鎖解析による腎細胞癌の悪性度評価法」
    西村紳一郎、三浦嘉晃、中原拓、天野麻穂、大山力、畠山真吾
  5. （特願2009-229046）
    「糖鎖分析による婦人科がんの診断方法」
    西村紳一郎、三浦嘉晃、中原拓、天野麻穂、青木大輔、鈴木淳