2015 : Biomics Hub

Publications

  1. Murakami K., Günesdogan U., Zylicz JJ., Tang WW., Sengupta R., Kobayashi T., Kim S., Butler R., Dietmann S., Surani MA.
    NANOG alone induces germ cells in primed epiblast in vitro by activation of enhancers
    Nature. 529, 403-407, Jan 21 (2016)
  2. Suzuki S., Kato H., Suzuki Y., Chikashige Y., Hiraoka Y., Kimura H., Nagao K., Obuse C., Takahata S., Murakami Y.
    Histone H3K36 trimethylation is essential for multiple silencing mechanisms in fission yeast.
    Nucleic Acids Res. (2016) [Epub ahead of print]
  3. Tsujii A., Miyamoto Y., Moriyama T., Tsuchiya Y., Obuse C., Mizuguchi K., Oka M., Yoneda Y.
    Retinoblastoma-binding Protein 4-regulated Classical Nuclear Transport Is Involved in Cellular Senescence.
    J Biol Chem. 290(49):29375-29388 (2015)
  4. Tatematsu M., Funami K., Ishii N., Seya T., Obuse C., Matsumoto M.
    LRRC59 Regulates Trafficking of Nucleic Acid-Sensing TLRs from the Endoplasmic Reticulum via Association with UNC93B1.
    J Immunol. 195(10):4933-4942 (2015)
  5. Hayashi-Takanaka Y., Maehara K., Harada A., Umehara T., Yokoyama S., Obuse C., Ohkawa Y., Nozaki N., Kimura H.
    Distribution of histone H4 modifications as revealed by a panel of specific monoclonal antibodies.
    Chromosome Res. 23(4):753-766 (2015)
  6. Kimoto C., Moriyama T., Tsujii A., Igarashi Y., Obuse C., Miyamoto Y., Oka M., Yoneda Y.
    Functional characterization of importinα8 as a classical nuclear localization signal receptor.
    Biochim Biophys Acta. 1853(10 Pt A):2676-2683 (2015)
  7. Perpelescu M., Hori T., Toyoda A., Misu S., Monma N., Ikeo K., Obuse C., Fujiyama A., Fukagawa T.
    HJURP is involved in the expansion of centromeric chromatin.
    Mol Biol Cell. 26(15):2742-2754 (2015)
  8. Moriyama T., Sangel P., Yamaguchi H., Obuse C., Miyamoto Y., Oka M., Yoneda Y.
    Identification and characterization of a nuclear localization signal of TRIM28 that overlaps with the HP1 box.
    Biochem Biophys Res Commun. 462(3):201-207 (2015)
  9. Kazuno S., Furukawa J., Shinohara Y., Murayama K., Fujime M., Ueno T., Fujimura T.
    “Glycosylation status of serum immunoglobulin G in patients with prostate diseases.”
    Cancer Med. doi: 10.1002/cam4.662. (2016)
  10. Kanagawa M., Kobayashi K., Tajiri M., Manya H., Kuga A., Yamaguchi Y., Akasaka-Manya K., Furukawa J., Mizuno M., Kawakami H., Shinohara Y., Wada Y., Endo T., Toda T.
    Identification of a Post-translational Modification with Ribitol-Phosphate and Its Defect in Muscular Dystrophy.
    Cell Rep. 14(9), 2209-2223 (2016)
  11. Furukawa J., Sakai S., Yokota I., Okada K., Hanamatsu H., Kobayashi T., Yoshida Y., Higashino K., Tamura T., Igarashi Y., Shinohara Y.
    Quantitative glycosphingolipid-glycome analysis of human whole serum based on an endoglycoceramidase digestion and glycoblotting method
    Lipid Res. 56(12), 2399-2407 (2015)
  12. Furukawa J., Piao J., Yoshida Y., Okada K., Yokota I., Higashino K., Sakairi N., Shinohara Y.
    Quantitative O-Glycomics by Microwave-Assisted β-Elimination in the Presence of Pyrazolone Analogues.
    Anal Chem. 87(15), 7524-8 (2015)
  13. Furukawa J., Tsuda M., Okada K., Kimura T., Piao J., Tanaka S., Shinohara Y.
    Comprehensive glycomics of a multistep human brain tumor model reveals specific glycosylation patterns related to malignancy
    PLOS ONE 10, e0128300 (2015)
  14. Xin X., Akasaka-Manya K., Manya H., Furukawa J., Kuwabara N., Okada K., Tsumoto H., Higashi N., Kato R., Shinohara Y., Irimura T., Endo T.
    POMGNT1 is glycosylated by mucin-type O-glycans
    Biol Pharm Bull. 38(9), 1389-94 (2015)
  15. Takano S., Matsuda S., Funabiki A., Furukawa J., Yamauchi T., Tokuji Y., Nakazono M., Shinohara Y., Takamure I., Kato K.
    The rice RCN11 gene encodesβ1,2-xylosyltransferase and is required for plant responses to abiotic stresses and phytohormones
    Plant Sci. 236, 75-88 (2015)
  16. Yuyama K., Sun H., Usuki S., Sakai S., Hanamatsu H., Mioka T., Kimura N., Okada M., Tahara H., Furukawa J., Fujitani N., Shinohara Y., Igarashi Y.
    A potential function for neuronal exosomes: sequestering intracerebral amyloid-β peptide
    FEBS Lett. 589, 84-88 (2015)

Books etc

  1. 古川潤一、篠原康郎
    総合グライコミクスで細胞を記述する
    化学と生物. Vol.53, No.9 (2015)
  2. Shinohara Y., Furukawa J., Miura Y.
    Glycome as biomarkers
    Biomarkers in Disease: Methods, Discoveries and Applications, 111-140, Springer Netherlands. (2015)

Conference Activities & Talks

(Invited talk)

  1. August 2015
    Awaji, japan
    International Symposium on Chromatin Structure, Dynamics, and Function
    DNA Double Strand Breaks Repair Pathway Is Controlled by Differential Phosphorylation of 53BP1
    Obuse C.
  2. 2015年9月
    札幌市
    第40回内藤コンファレンス
    From Histone Code to Higher Order Chromatin Structure on Inactive X Chromosome
    小布施　力史

(Oral presentation)

  1. August 2015
    Vienna, Austria
    24th Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus,
    DNA repair pathway is controlled by differential phosphorylation of 53BP1
    Obuse C.

Invited talk (in Japan)

  1. 2016年1月
    京都市
    京都大学・生体分子機能化学セミナー
    HP1から見えてきたヘテロクロマチンの構造と機能
    小布施　力史
  2. 2015年12月
    神戸市
    BMB2015（第38回日本分子生物学会年会　第88回日本生化学会大会 合同大会）
    SCAIはRif1の機能を調節することによって二本鎖切断損傷の相同組換え修復を促進する
    小布施　力史
  3. 2015年12月
    神戸市
    BMB2015（第38回日本分子生物学会年会　第88回日本生化学会大会 合同大会）
    ヒトPRC2（Polycomb Repressive Complex 2） 複合体構成因子の解析
    石本　洋平、蛯名　峰子、柴田　幸子、山口　康祐、磯部　真也、大久保　義真、長尾　恒治、小布施　力史
  4. 2015年10月
    三島市
    平成27年度遺伝研研究会
    HP1結合タンパク質の解析によるクロマチン機能階層構造の解明
    小布施　力史
  5. 2015年9月
    熊本市
    熊本大学理学部プロゼミ
    ヘテロクロマチンの構造と機能
    小布施　力史
  6. 2015年9月
    熊本市
    第257回発生研セミナー
    ヒトHP1の解析から見えてきたヘテロクロマチンの構造と機能
    小布施　力史
  7. 2015年7月
    札幌市
    日本赤十字社シンポジウム・第27回北海道輸血シンポジウム
    女性の“働かない”Ｘ染色体の仕組み
    小布施　力史
  8. 2015年7月
    熊本市
    日本プロテオーム学会2015年会
    HP1とポリコーム複合体2（PRC2）との連携とヘテロクロマチンの機能構造
    小布施　力史
  9. 2015年7月
    柳川市
    第33回内分泌代謝学サマーセミナー
    質量分析器と次世代シーケンサーを駆使したクロマチン研究
    長尾　恒治
  10. 2015年5月
    福岡市
    第15回日本抗加齢医学会総会
    女性X染色体不活性化とエピゲノムとヘテロクロマチン
    小布施　力史
  11. 2015年10月
    名古屋市
    第74回日本癌学会学術総会　Symposium
    Comprehensive glycomics of multistep human brain model reveals specific glycosylation patterns related to malignancy
    篠原　康郎

Patent

なし