2013年度:バイオミクスイノベーションハブ

発表論文

  1. Hoshina S., Yura K., Teranishi H., Kiyasu N., Tominaga A., Kadoma H., Nakatsuka A., Kunichika T., Obuse C., Waga S.
    Human origin recognition complex binds preferentially to G-quadruplex-preferable RNA and single-stranded DNA.
    The Journal of biological chemistry, 288, 30161-30171 (2013)
  2. Sato Y., Mukai M., Ueda J., Muraki M., Stasevich T.J., Horikoshi N., Kujirai T., Kita H., Kimura T., Hira S., Okada Y., Hayashi-Takanaka Y., Obuse C., Kurumizaka H., Kawahara A., Yamagata K., Nozaki N., Kimura H.
    Genetically encoded system to track histone modification in vivo.
    Sci. Rep., 3, 2436 (2013)
  3. Nozawa R.S.*, Nagao K.*, Igami K.T.*, Shibata S., Shirai N., Nozaki N., Sado T., Kimura H., Obuse C.
    Human inactive X chromosome is compacted through a polycomb-independent SMCHD1-HBiX1 pathway.
    Nature Struct. Mol. Biol., 20, 566-573. *equal contribution (2013)
  4. Tanaka Y, Umata T, Okamoto K, Obuse C, Tsuneoka M,
    CxxC-ZF Domain Is Needed for KDM2A to Demethylate Histone in rDNA Promoter in Response to Starvation.
    Cell Structure and Functions., 39(1), 79-92, (2014)
  5. Kato K., Takegawa Y., Ralston K.S., Gilchrist C.A., Hamano S., Petri WA Jr., Shinohara Y.
    Sialic acid-dependent attachment of mucins from three mouse strains to entamoeba histolytica.
    Biochem Biophys Res Commun, 436, 252-258 (2013)
  6. Yamada K., Ito K., Furukawa J.I., Nakata J., Alvarez M., Verbeek J.S., Shinohara Y., Izui S.
    Galactosylation of IgG1 modulates FcγRIIB-mediated inhibition of murine autoimmune hemolytic anemia
    J Autoimmun, 47, 104-110 (2013)
  7. Sasazawa F., Onodera T., Yamashita T., Seito N., Tsukuda Y., Fujitani N., Shinohara Y., Iwasaki N.
    Depletion of gangliosides enhances cartilage degradation in mice.
    Osteoarthritis Cartilage, 22, 313-322 (2014)
  8. Ito K., Furukawa J., Yamada K., Tran N.L., Shinohara Y., Izui S.
    Lack of galactosylation enhances the pathogenic activity of IgG1, but not IgG2a anti-erythrocyte.
    Autoantibodies. J. Immunol, 192, 581-588 (2014)
  9. Suzuki, S., Nagao, K., Obuse, C., Murakami, Y., and Takahata, S.
    A novel method for purification of the endogenously expressed fission yeast Set2 complex
    Protein Expr. Purif., 97, 44-49 (2014)

著書・総説・解説等

  1. 長尾恒治、野澤竜介、小布施力史
    バー小体の正体 – HBiX1-SMCHD1複合体によるヒト不活性化X染色体の凝縮
    実験医学 31, 1771-1775
  2. Katayama, T., Wilkinson, M. D., Micklem, G., Kawashima, S., Yamaguchi, A., Nakao, M., Yamamoto, Y., Okamoto, S., Oouchida, K., Chun, H. W., Aerts, J., Afzal, H., Antezana, E., Arakawa, K., Aranda, B., Belleau, F., Bolleman, J., Bonnal, R. J., Chapman, B., Cock, P., Eriksson, T., Gordon, P., Goto, N., Hayashi, K., Horn, H., Ishiwata, R., Kaminuma, E., Kasprzyk, A., Kawaji, H., Kido, N., Kim, Y. J., Kinjo, A. R., Konishi, F., Kwon, K. H., Labarga, A., Lamprecht, A. L., Lin, Y., Lindenbaum, P., McCarthy, L., Morita, H., Murakami, K., Nagao, K., Nishida, K., Nishimura, K., Nishizawa, T., Ogishima, S., Ono, K., Oshita, K., Park, K., Prins, P., Saito, T. L., Samwald, M., Satagopam, V. P., Shigemoto, Y., Smith, R., Splendiani, A., Sugawara, H., Taylor, J., Vos, R., Withers, D., Yamasaki, C., Zmasek, C. M., Kawamoto, S., Okubo, K., Asai, K., and Takagi, T.
    The 3rd DBCLS BioHackathon: improving life science data integration with semantic Web technologies. J.
    Biomed .Semantics, 4, pp 6 (2013)

国際学会

(口頭発表)

  1. August 2013
    Debrecen,Hungary
    23rd Wilhelm Bernhard Workshop on the cell nucleus
    Human inactive X chromosome is compacted through a Polycomb-independent SMACHD1-HBIX1 pathway governed by XIST RNA.
    Obuse C.

国内招待

  1. 2013年5月
    つくば市
    第60回日本実験動物学会
    プロテオミクス、ゲノミクスによるエピジェネティクスの機能階層構造の解明
    小布施 力史
  2. 2013年9月
    横浜市
    第86回日本生化学会大会
    ミクロなクロマチン研究で解くマクロなエピジェネティクス研究
    小布施 力史
  3. 2013年10月
    三島市
    平成25年度遺伝研研究会 
    ヒトヘテロクロマチンの構造と機能
    小布施力史
  4. 2013年12月
    神戸市
    第36回日本分子生物学会
    クロマチン構造の動的性質によるゲノム機能制御
    小布施力史
  5. 2013年12月
    つくば市
    日本エピジェネテイクスセミナー
    染色体不活性化とヘテロクロマチン
    小布施力史
  6. 2013年11月
    札幌市
    第4回グライコバイオロジクス研究会 
    総合的なグライコミクスによる細胞のキャラクタリゼーションと細胞マーカーの探索
    篠原 康郎
  7. 2013年11月
    神戸市
    第26回インターゲノミクスセミナー
    バー小体の正体 – SMCHD1-HBiX1複合体によるヒト不活性化X染色体の凝縮 –
    長尾恒治

特許

  1. 特許1件(詳細未公表)
    発明者: 篠原 康郎、 古川 潤一